La revue de littérature chercher à synthétiser les connaissances sur une question donnée. Là encore, il est préférable pour vous de faire une revue de littérature sur « le rôle d’Helicobacter pylori dans la pathogenèse de la maladie d’Alzheimer » plutôt que « la maladie d’Alzheimer » ou « Helicobacter pylori ».
Nous allons garder le même plan que pour les études qualitatives et les études quantitatives des deux précédents billets : choisir un type d’étude (selon votre objectif) – puis recueillir des données – puis les analyser.
Choisir le type d’étude
Il existe plusieurs types de revue de littérature :
- Revue narrative de la littérature (narrative review ou literature review) : vous ne cherchez pas l’exhaustivité ; c’est une méthode intégrative (et non agrégative) où vous organiserez les études en catégories logiques, avant de les décrire et les résumer ;
- Revue systématique de la littérature (systematic review) : c’est la « revue de littérature » classique qui répond à une question précise, en cherchant l’exhaustivité dans le recueil des études puis des données, et en évaluant le risque de biais des études (puis de la revue) ;
- Revue parapluie (umbrella review) : c’est une revue systématique… de revues systématiques !
- Revue rapide de la littérature (rapid review) : c’est une revue systématique… mais en omettant des méthodes spécifiques, pour gagner du temps (notamment pour répondre rapidement, par exemple aux débuts de pandémie COVID-19)
- Revue de la portée / de la délimitation de l’étendue (scoping review) : c’est comme une revue systématique… mais la question de recherche et le phénomène ne sont ni très précis, ni spécifiques. On l’utilise dans un domaine où la recherche est émerge (par exemple aux débuts des recherches sur le COVID Long).
- Méta-analyse : c’est une méthode statistique qui permet de résumer les résultats de plusieurs études en des estimations chiffrées (car le Petit Prince avait raison).
- etc.
Les grandes personnes aiment les chiffres. Quand vous leur parlez d’un nouvel ami, elles ne vous questionnent jamais sur l’essentiel. Elles ne vous disent jamais : quel est le son de sa voix ? Quels sont les jeux qu’il préfère ? Est-ce qu’il collectionne les papillons ? Elles vous demandent : Quel âge a-t-il ? Combien a-t-il de frères ? Combien pèse-t-il ? Combien gagne son père ? Alors seulement elles croient le connaître. — Antoine de Saint-Exupéry, Le Petit Prince.
En qualitatif, il existe également des méthodes de synthèse visant à créer un consensus : on a déjà parlé brièvement des groupes nominaux et de la méthode Delphi… Il en existe d’autres, uniquement sur la littérature :
- revue narrative qualitative : idem à la revue narrative quantitative ;
- méta-synthèse qualitative et méta-ethnographie : similaire à une revue systématique, sur des études qualitatives, afin de synthétiser (et générer) de nouvelles connaissances ;
- revues critiques, revues réalistes : évaluer ou expliquer les phénomènes ;
- etc.
Recueillir des données : modalités de recueil et modalités d’échantillonnage
Nous nous attarderons ici sur la revue systématique de littérature.
Elle répond à des étapes claires, précises, rigoureuses et transparentes (pour être reproductible), notamment détaillées par la revue Cochrane :
- définir la question de recherche (avec le cadre PICO)
- rédiger un protocole avec les critères d’inclusion et d’exclusion des études
- choix des bases de données à interroger et méthodes d’analyses prévues
- création de l’équation de recherche
- recherche exhaustive dans les bases de données choisies
- sélection des études en double aveugle
- analyse des études avec leurs résultats et leurs biais (selon la grille Cochrane par exemple)
- synthèse des résultats : qualitative ou parfois quantitative (méta-analyse)
- évaluation de la qualité des preuves (GRADE)
Insistons ici sur l’importance de tout noter dès le départ : votre diagramme de flux listera les études incluses, exclues, le stade et motif d’exclusion (doublons, hors sujet à la lecture du titre car sur l’animal / sur une autre population etc., exclus après lecture du résumé, exclus après lecture de l’article complet).
Quand s’arrêter ?
Dans une revue systématique de littérature, on vise l’exhaustivité sur une période choisie.
Cela soulève surtout la question du temps (si on part de 15 000 études, c’est… compliqué pour une thèse de médecine). Il convient donc de prévoir une question (et donc une équation) de recherche réaliste, visant un problème précis, éventuellement dans un sous-groupe…
Logiciels d’analyse
Il existe plusieurs outils et logiciels d’analyse pour la revue systématique de littérature, tels que Covidence… payant à 289$/an par étudiant. Voici des alternatives gratuites :
Il y a aussi Systematic Review Toolbox qui permet de trouver des outils selon le type de votre revue, et le stade (protocole, sélection, analyse…)
Analyse des données
Le travail va se baser en 3 temps : transcrire – décrire (coder) – analyser (organiser)
Transcrire
Vous allez synthétiser les données recueillies dans des tableaux prévus à cet effet (notamment ceux de la grille PRISMA – nous reparlerons dans 2 jours des grilles, sujet que j’ai pour l’instant choisi de garder de côté pour essayer d’avoir des billets assez courts et didactiques).
La sélection des études en double aveugle permet d’améliorer la qualité de votre sélection et donc de votre revue.
Décrire
Vous allez reporter des éléments tels que :
- le nom de l’étude (par exemple Auteur. Revue (Année) [réf]),
- le type d’étude,
- les années,
- le public,
- le test choisi,
- les résultats principaux
Analyser
L’analyse peut être textuelle et/ou faire appel à des techniques de méta-analyse :
- identifier les thématiques principales (sections de votre chapitre résultats)
- repérer les convergences et divergences (qui seront discutées : méthodologies différentes, populations différentes, biais, etc.)
- synthétiser avec des tableaux (et éventuellement des graphiques ou diagrammes – forest-plot pour une méta-analyse notamment).
Une attention particulière est portée aux biais dans les revues de littérature et méta-analyse :
- biais des études sélectionnées : sont-elles de qualité ?
- biais de la littérature : y’a-t-il des biais de publication ? (recours à un funnel plot)
- biais de la revue elle-même : biais de sélection, etc.
Après avoir balayé les principales méthodes utilisées en thèse de médecine, nous allons parler de réglementation, et entrer un peu plus dans le détail en fournissant des outils utiles pour préparer l’étude… avant d’attaquer les résultats.
